本校附屬醫院運營管理機制與監督，為管發中心營運績效組業務範疇，完善附屬醫院體系財務、營運、作業流程等相關管理機制，並對附屬醫院營運上負監督之責，擬定營運目標，因應政策環境變化，對營運策略或方針提出分析與建議，扮演校院或院際間之溝通平台建立共識，以期提升附屬醫院營運績效成果。
本校院體系發展至今已具相當規模，未來醫療體系之發展目標、策略、評估與規劃等，同為本組之重要任務，以落實達成北醫大體系擴大規模與之理念。
營運績效組主要任務
n建立體系經營管理制度與營運追蹤分析
n北醫大體系醫療業務發展規劃
n建立附屬醫院經營管理相關指標與追蹤檢討
n擬定附屬醫院經營管理規章制度
n各類營運專案分析與評估
n附屬醫院300萬以上醫療設備採購評估與效益追蹤
n附屬醫院合作經營案評估與成效追蹤